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RNA的完整性质控
来源: | 作者:201321492800086 | 发布时间: 313天前 | 482 次浏览 | 分享到:
RNA是以DNA的一条链为模板,以碱基互补配对原则,转录而形成的一条单链,主要功能是实现遗传信息在蛋白质上的表达,是遗传信息向表型转化过程中的桥梁。在此过程中,转运RNA(Transfer RNA,tRNA)是携带与三联体密码子对应的氨基酸残基与正在进行翻译的mRNA结合,而后核糖体RNA(Ribosomal RNA,rRNA)将各个氨基酸残基通过肽键连接成肽链进而构成蛋白质分子。其分类可分为四类:mRNA、rRNA、tRNA、miRNA、小分子RNA。

RNA是以DNA的一条链为模板,以碱基互补配对原则,转录而形成的一条单链,主要功能是实现遗传信息在蛋白质上的表达,是遗传信息向表型转化过程中的桥梁。在此过程中,转运RNA(Transfer RNA,tRNA)是携带与三联体密码子对应的氨基酸残基与正在进行翻译的mRNA结合,而后核糖体RNA(Ribosomal RNA,rRNA)将各个氨基酸残基通过肽键连接成肽链进而构成蛋白质分子。其分类可分为四类:mRNA、rRNA、tRNA、miRNA、小分子RNA。


无论是做植物研究还是动物研究,无论是容易抽提的组织还是难抽提的组织,抽提好Total RNA,小RNA,外泌体RNA等核酸后,质控是关键。特别是容易降解的Total RNA,全自动核酸质控仪可降低环境RNA消解酶对样本的影响,可提供直观的量化RNA Quality Number值作为评断参考(图1),还有浓度低的小RNA(图2),跑普通电泳是完全不可行的,可以用Qsep100全自动核酸蛋白分析系统或者其他同类产品进行检测,样本消耗只需1μL,检测结果清晰明了。


图1 Total RNA质控

图2 小 RNA质控

目前,各地医院在积极构建生物样本库,利用生物样本开展细胞、分子、基因、蛋白质层面的研究,可以展开疾病诊断、个性化治疗的研究。在新药开发中,可以应用大规模生物样本进行药物敏感性和特异性的研究。在药物治疗方面,可以基于生物样本进行药物相关研究,包括药物与基因多态性的关联等,为指导个性化用药提供参考。生物样本库会收集正常人和病人的尿液、粪便、血液和病理组织进行低温冻存或者粗提DNA和RNA后冻存,以备后期研究需要,当同类型样本累计到一定数量之后就可以对同类病例进行遗传分析,从遗传学层面发现病因,以期寻找更加先进的治疗方式,是非常具有价值的样本积累过程。


全自动仪器可检测样本储存后的情况,反应样本状态,为下游实验提供方案选择和调整的参考。现在NGS火爆流行,建库成功的前提就在于样本核酸的完整性程度来选择合适的建库试剂盒和建库方式。图3是对RNA不同完整性样本的检测(原图可参考文献:A Nucleic Acid Quality Control Strategy for Frozen Tissues from a Biobank of High-Risk Pregnancy)。



图3 不同完整性质量的Total RNA