导读
在进行分子生物学实验时，我们经常从众多的分子片段中筛选出目的片段的核酸，从而进行后续的实验研究。最经典的方案是，使核酸在电场的作用下在琼脂糖凝胶中发生分离，然后在紫外光的照射下切取目的片段处的凝胶，进而纯化回收核酸。从琼脂糖凝胶中回收核酸，虽然是一项简单常规实验操作，但是也会存在很多因素影响胶回收的质量( 回收产物的纯度和浓度等)和DNA含量，进而直接影响后续的一系列实验的进行，比如：PCR扩增、酶切连接、转化筛选、测序、标记乃至显微注射等。因此DNA凝胶回收这一步的操作也显得非常重要。
在载体构建的过程中，无论是通过酶切还是PCR扩增方法获得的目的片段，其中都可能会存在引物、非特异性扩增片段等干扰项。如下图1实验，分别采用全自动核酸片段回收系统和磁珠纯化的方法去除非目标片段，随后进行连接、转染，实验结果表明，采用全自动核酸片段回收系统，获得的单克隆抗体的阳性率达到92%，磁珠纯化的方法，获得的单克隆抗体的阳性率只有29%。
在高通量测序文库构建过程中，打断样本及文库样本的片段筛选是非常重要的一步。如图2所示，分布较为弥散的超声打断样本经过全自动核酸片段回收系统筛选回收后，可以精准富集500-700bp的目的片段。如图3所示，文库样本经过回收后，可以完全去掉引物及接头残留，并去除文库两端的大片段和小片段，以保证获得测序仪下机的高质量数据。
图2 打断样本回收前（红色）后（蓝色）对比
图3 文库样本回收前（红色）后（蓝色）对比
在Nanopore三代测序中，文库片段的筛选回收同样是非常重要的一步。如下实验，分别将经过片段筛选回收和未进行片段筛选的文库样本进行上机测序。结果表明，同一样本在相同时间内产生的数据量相差20GB，且经过片段筛选的样本获得的读长更长，显著提高了测序的效率。
图4. Nanopore文库片段筛选前（左图）后（有图）测序读长区别
在肿瘤研究或产前诊断方向，游离DNA一直是科研工作者重点关注的一类样本。近年来许多研究表明ctDNA和cfDNA的片段长短存在差异，来自肿瘤/胎儿细胞的ctDNA比来自正常/母体细胞的cfDNA（~166 bp）更短，为132~145 bp。来自正常组织/器官的游离DNA数量远远超过了来自早期肿瘤、胎儿的游离DNA。基于此特性，在对游离DNA文库上机测序前，通过全自动核酸回收系统对ctDNA文库筛选富集，尽量减少cfDNA文库占比，可以显著提高ctDNA的信号值，得到更多有效数据。
图5 游离DNA文库样本回收前（红色）后（蓝色）对比
与传统的手动切胶回收相比，LightBench®全自动核酸电泳回收分析系统减少了繁琐的凝胶制备、上样、DNA电泳分离、目的条带切割回收等操作步骤，可实现目的核酸片段的精准回收，而且具有更高的回收率、准确性和可重复性。此外，该系统还兼具电泳分析和荧光浓度测定的功能。
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杭州厚泽生物科技有限公司于2013年成立，是一家集科学仪器、耗材、试剂的销售、推广和售后服务为一体的高科技生物企业。公司成立之初，致力推广NGS质检的国产化仪器——Qsep全自动核酸蛋白分析系统，后与中国台湾光鼎在江苏成立合资公司江苏光鼎，完成了NGS质检仪器国产化生产。又先后与多个著名生物技术产品制造商达成合作，提高了代理产品丰富度，建立了完整的产品体系与服务体系。
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2. INB-D200 生物标志物检测分析仪
3. iCATCHER 12全自动核酸提取仪
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