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毛细管电泳技术助力宏基因组测序
来源: | 作者:201321492800086 | 发布时间: 120天前 | 312 次浏览 | 分享到:
在人类的历史中,人们经常会受到各种传染病的困扰,可以说人类发展史同时也是人类与传染病斗争的历史。诊断、治疗和预防是人类与传染病斗争的三个关键环节。其中,最为关键的是及时正确诊断,在正确诊断的基础上才能够进行有效的治疗,制定有效的预防策略。及时发现、有效鉴别、快速诊断和提出预警,这是现代最前沿的传染病防治体系。

在人类的历史中,人们经常会受到各种传染病的困扰,可以说人类发展史同时也是人类与传染病斗争的历史。诊断、治疗和预防是人类与传染病斗争的三个关键环节。其中,最为关键的是及时正确诊断,在正确诊断的基础上才能够进行有效的治疗,制定有效的预防策略。及时发现、有效鉴别、快速诊断和提出预警,这是现代最前沿的传染病防治体系。


在临床感染性病原体探寻的过程中,临床医生时常会面对新发病原体想不到、疑难感染病原体没想到、或者由于检测技术受限想到没检测到的困境,现有的临床辅助诊断方式与临床的迫切需求之间还存在着巨大的鸿沟。而基于宏基因组新一代测序技术(metagenomics next generation sequencing, mNGS) 不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,能够快速、客观的检测临床样本中的多种病原微生物(包括病毒、细菌、真菌、寄生虫),尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。随着mNGS 技术平台的完善和临床研究的增多,mNGS在临床上的运用将越来越广泛。mNGS的适时使用,可以准确快速的帮助临床明确患者发热病因,推动临床的精准诊断。


而在本次新型冠状病毒疫情的爆发中,基因测序为我们确定病原体,及时研发诊断试剂盒做出了很大的贡献。基因测序对动态监控病毒的变异也意义重大。针对新冠病毒宏基因组测序样品,我们的Qsep系列全自动核酸蛋白分析系统采用毛细管电泳的技术,可以为您提供从RNA和cDNA完整性质控到文库质控的全自动解决方案,助您完成高通量的mNGS文库实验,得到良好的测序结果。


对于RNA 的质控,可根据直观的RQN (RNA quality number)值来判断样本的质量,RQN 值越接近于10 Total RNA质量越好(见图1)。RNA质控合格后,即可进行下一步的实验。逆转录得到的cDNA同样也需要进行质控,来判断得到cDNA的大小是否合适(见图2)

图1  RNA 的质控(Qsep结果图)

图2  cDNA的质控(Qsep结果图)

在得到的文库之后,需要检测接头残留情况,以及文库的片段大小是否合适,在质控合格后,就可以上测序仪进行测序了(见图3)。Qsep系列全自动核酸蛋白分析系统采用现在兴起的全自动毛细管电泳,可以较低的成本完成对样本的质控,且分辨率和灵敏度都很高,可如实反应样本的真实情况,是现在NGS公司在核酸质控方面值得考虑的一款仪器。

图3  文库的质控(Qsep结果图)